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💡专注R语言在🩺生物医学中的使用 设为“星标”,精彩不错过 前面我们已经讲过逻辑回归模型的校准曲线的画法,这次我们学习cox回归的校准曲线画法。 准备数据 使用自带数据lung数据集进行演示。 这个是关于肺癌的生存数据,一共有228行,10列,其中time是生存时间,单位是天,status是生存状态,1是删失,2是死亡。其余变量是自变量,意义如下: inst:机构代码,对于我们这次建模没啥用age:年龄sex:1是男性,2是女性ph.ecog:ECOG评分。0=无症状,1=有症状但完全可以走动
大家好,我是邓飞,今天介绍一下TwoSampleMR包如何设置token,从而可以使用数据库的数据进行孟德尔随机化的分析。 1,安装TwoSampleMR包 这个包在github上面,之前流行用devtools包安装github上的R包,但是devtools本身就特别难安装,好在现在有了 remotes包,这个包比较好安装,进而github上面的包也比较好安装了。 # install.packages("remotes")library(remotes)install_github("MRCI
俗话说得好,手巧不如家什妙! 这句话的意思是人的手再灵 巧,也不如有好的工具。手艺再好,也得靠趁手或先进的工具帮忙。 第一款FastStone Capture {jz:field.toptypename/} 图片 FastStone Capture是一款体积小巧却功能强大、简单易用的屏幕捕捉工具。 它集屏幕截图、图像编辑与视频录制等功能于一身。能够捕捉屏幕上的任意区域,提供多种捕获方式,如活动窗口、指定窗口/对象、矩形区域、手绘区域、整个屏幕、滚动窗口等。此外,还附带屏幕录像机、放大镜、取色器
图片 前言 Hello小伙伴们大家好,我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是肺腺癌单细胞数据集GSE189357复现系列第三期。第二期我们对细胞亚群进行了注释(肺腺癌单细胞数据集GSE189357复现(二):细胞注释)。 本期,我们将使用多种可视化方法,绘制FeaturePlot,ggplot,DoHeatmap图。 1.背景介绍 在胃癌系列推文中,我提到绘好看图需要审美能力强。实际上,绘图能力也能很好的反映我们的科研素养。绘图能力与科研能力之间的关系非常紧密,因为有效的可视化在科学研
前情回顾 在这个月的前几期推文中,主要基于单细胞数据使用小提琴图可视化marker基因进行了整理: VlnPlot结果及常用参数浅析 基于VlnPlot参数及ggplot2美化小提琴图 也有一期答读者问——小提琴图有点无图是何缘由? 这期就一起来学习一下画目的基因的小提琴图并计算显著性! 小提琴图可视化并计算显著性用途 在单细胞数据分析中,通过小提琴图可视化和显著性计算可以帮助研究者直观且统计地评估目的基因在不同细胞群体中的表达差异 展示基因在不同细胞群体的表达分布:小提琴图可以直观地展示基因
好了,写了好几篇的聚类,有同学都在问虾神,说没想到你这个浓眉大眼的家伙也当叛徒了,背叛了空间统计学队伍……好吧,还是那句话,空间统计学是虾神的看家本领,所以那是肯定不能丢掉的。 当然,今天我们要讲的还是聚类,不过是妥妥的空间聚类。 话说,前面一直都在强调,空间分布模式主要就是三种: {jz:field.toptypename/} 图片 而全局的莫兰指数可以通过计算公式,来表明整个研究空间中的样本数据所表达出来的总体特征,但是这个总体特征是所有模型加权出来的结果,自然就会掩盖掉里面的很多细节。
建站客服QQ:88888888 作者建议:We recommend all users to consider using [LIANA+](https://liana-py.readthedocs.io/en/latest/index.html), instead of LIANA, due to it's increased efficiency and completeness. We plan to eventually port all LIANA+ functionalit
发现现在大家都开始重视起了个人上网隐私问题!很好!毕竟,谁都不希望自己的上网踪迹被肆意窥探,个人数据无端泄露。下面整理了一些实用的保护网隐私与数据安全方法,以下这些实用建议值得参考: 图片 1. 启用隐私模式浏览网页 几乎所有主流浏览器,像是Chrome、Firefox、Safari 等,均贴心地设有隐私或无痕模式。开启该模式后浏览网页,浏览器便不会留存您的历史记录、Cookie 以及网站数据。换言之,待您关闭浏览器窗口的瞬间,那些浏览痕迹统统会被一键删除,旁人自然没机会查看您的上网轨迹。 不
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你是否曾经遇到过这些问题: - 想快速了解某个知识点,但不知道从哪里开始? - 需要处理一份文件,但觉得太复杂无从下手? - 想写一篇文章或邮件,却不知道如何组织语言? 别担心,DeepSeek 就是为你准备的!它是一款智能助手,可以帮助你解决这些问题。即使你完全不懂技术,也能轻松上手。下面,我将从普通人的角度,带你一步步了解如何使用 DeepSeek。 图片 1. 什么是 DeepSeek? DeepSeek 是一款基于人工智能的工具,你可以把它想象成一个“万能助手”。它能回答你的问题、帮你
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